大きな紛争後の世界。
名門学校クラスターE.Aにアゲート・フローライトという名の少年が編入してくる。
不思議な力を秘めた彼を中心に学園生のベリルやフォンらは次第に影響を受けてゆく。
一方、学園の外では戦争中に兵器として使用された感情を殺された人間「人造兵」が既に必要のないものとして処分されつつあった。